GERSOM - Studio di fattibilità per la diagnosi genomica congiunta di rischio genetico e di sensibilità ai nuovi farmaci nelle neoplasie della mammella, ovaio e colon-retto.

Studio Clinico

Patologia: Neoplasie della mammella, Tumori del colon retto, Tumori dell’ovaio

Osservazionale-Sperimentale: Sperimentale

Monocentrico-Multicentrico: Multicentrico

Randomizzato: No

Fase di studio: Non applicabile

Linee di trattamento: Non applicabile

Criteri di inclusione: 

Ovaio
1. Pazienti di nuova diagnosi di tumori epiteliali dell’ovaio, del peritoneo o della tuba di Falloppio di qualsiasi istologia e stadio con l’eccezione dei tumori borderline che abbiano in programma di ricevere procedura diagnostica o terapeutica invasiva (chirurgia o biopsia). In caso di terapia neo-adiuvante disponibilità del campione bioptico pre-trattamento;
2. Età > 18 anni;
3. Consenso informato scritto;
4. Pazienti con recidiva di malattia non pretrattata o trattata con non più di una precedente linea di terapia, che abbiano in programma di ricevere procedura diagnostica o terapeutica invasiva (chirurgia o biopsia), a condizione che tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni e una nuova biopsia pre-arruolamento nel trial sia fattibile;
5. Pazienti in remissione di malattia (identificati durante il follow up) che non abbiano ricevuto più di una precedente linea di terapia a condizione che tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni.
Mammella
1. Carcinoma mammario triplo negativo (ER e PgR <10% ed HER2 negativo: IHC 0, 1+ or 2+ ISH non amplificato) o insorto in pazienti con età < 40 anni che abbiano in programma di ricevere procedura diagnostica o terapeutica invasiva (chirurgia o biopsia);
2. Sono arruolabili le pazienti:
    - in fase iniziale (setting neoadiuvante o adiuvante). In caso di terapia neo-adiuvante disponibilità del campionamento bioptico pre-trattamento con chemioterapia.
    - in fase metastatica. In caso di malattia metastatica è consentito un trattamento chemioterapico precedente per carcinoma mammario in fase iniziale (setting neoadiuvante e/o adiuvante), a condizione che il tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni ed una nuova biopsia pre-arruolamento nel trial sia fattibile.
    - in remissione di malattia (identificate durante il follow up) che non abbiano ricevuto più di una precedente linea di terapia (in qualsiasi setting) a condizione che tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni;
3. Età >18 anni;
4. Consenso informato scritto.
Colon-retto
1. Pazienti di nuova diagnosi di tumore colo-rettale (inclusa la malattia metastatica) che abbiano in programma di ricevere procedura diagnostica o terapeutica invasiva (chirurgia o biopsia). In caso di terapia neo-adiuvante disponibilità del campione bioptico pre-trattamento;
2. Età > 18 e < 50 anni;
3. Consenso informato scritto;
4. Pazienti con recidiva di malattia non pretrattata o trattata con non più di una precedente linea di terapia, che abbiano in programma di ricevere procedura diagnostica o terapeutica invasiva (chirurgia o biopsia), a condizione che tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni e una nuova biopsia pre-arruolamento nel trial sia fattibile;
5. Pazienti in remissione di malattia (identificati durante il follow up) che non abbiano ricevuto più di una precedente linea di terapia a condizione che tessuto paraffinato del tumore primitivo non pretrattato sia disponibile e non più datato di 2 anni.

Criteri di esclusione: 

1. Impossibilità o non volontà di sottoporsi a consulenza onco-genetica;
2. Più di 1 precedente linea di chemioterapia (in qualsiasi setting di malattia);
3. In caso di pazienti arruolati in assenza di malattia e identificati durante FU, non disponibilità di tessuto tumorale non pretrattato entro 2 anni;
4. Per le pazienti arruolate in presenza di malattia attiva, sede di malattia inaccessibile a campionamento bioptico.

Trattamento sperimentale: 

-

Trattamento di controllo: 

-

Obiettivi primari dello studio: 

Obiettivo primario dello studio sarà quello di validare con metodologia standard le mutazioni germinali e somatiche identificate con il pannello Gersom.

Obiettivi secondari dello studio: 

1. Identificazione nelle 3 popolazioni in studio della prevalenza delle mutazioni genetiche germinali contenute nel pannello Gersom;
2. Identificazione nelle 3 popolazioni in studio della prevalenza delle mutazioni somatiche contenute nel pannello Gersom;
3. Identificazione nelle 3 popolazioni in studio della prevalenza delle Copy Number Variations (CNV) dei geni contenuti nel pannello;
4. Valutazione della frequenza di 196 single- nucleotide polymorphisms (SNPs) inclusi nel pannello Gersom relati al metabolismo dei farmaci utilizzati nella pratica clinica per il trattamento dei tumori in studio;
5. Valutare le correlazioni tra mutazioni germinali e prognosi in termini di progression free survival (PFS) e overall survival (OS);
6. Valutare le correlazioni tra mutazioni somatiche e prognosi in termini di PFS e OS;
7. Valutare le correlazioni tra mutazioni germinali e somatiche e caratteristiche istomorfologiche, caratterizzazione immunofenotipica, grading e stadiazione alla diagnosi, della lesione tumorale;
8. Valutazione della riproducibilità del pannello genico utilizzato tra i singoli laboratori;
9. Determinazione della percentuale di mutazioni individuate con il pannello GerSom che sono validate con altre metodiche standard;
10. Valutazione dell'alterazione dei livelli di espressione di geni actionable, anche in assenza di mutazioni;
11. Monitoraggio dei cambiamenti di espressione dei processi biologici rilevanti per lo studio della malattia e della scelta terapeutica;
12. Utilizzo delle varianti germinali associate per il calcolo di uno “score” di rischio poligenico;
13. Valutazione di eventuali differenze in termini di mutazioni somatiche nei pazienti pretrattati sul campione tissutale prima e dopo trattamento;
14. Definizione e validazione di un percorso di interpretazione clinica delle varianti di significato incerto;
15. Valutazione della applicabilità clinica del pannello genico in termini di tempistiche orientate al decision making process e percentuale di campioni idonei alla analisi;
16. Costituzione di una rete macroregionale di laboratori secondo il modello Hub and spoke;
17. Validazione di protocolli condivisi di gestione delle problematiche etiche e legali connesse al percorso onco-genetico (consulenza genetica, consenso informato, privacy, Incidental Findings, etc);
18. Caratterizzazione del trascrittoma sul tessuto tumorale con strategie di sequenziamento massivo parallelo a basso costo dei pazienti arruolati nel programma GerSom e genotipizzazione di SNPs a livello dell’intero genoma mediante analisi di microarray.
19. Correlazione tra le firme genomiche e trascrittomiche identificate dal pannello Gersom e l’outocome radioterapico in termini di efficacia e tossicità nei tumori del colon e della mammella.
20. Analisi di CNV genome-wide tramite metodica CUT-seq dei pazienti arruolati nel protocollo Gersom.
21. Allestimento di una biobanca distribuita per la raccolta di plasma per valutazioni di circulating tumor DNA.
22. Analisi del ctDNA tramite NGS e digital PCR (dPCR) al fine di identificare Minimal Residual Disease (MRD) e altre alterazioni genomiche circolanti (in una coorte di 25 pazienti affetti da carcinoma del colon-retto).

Periodo previsto di arruolamento: 36 mesi circa

Centri partecipanti

Nord Italia

Centro Italia

Sud Italia e isole

Informazioni Generali

Protocollo

Numero di iscrizione a registro: NA

Data di inserimento: 19.05.2023

Promotore

Alleanza contro il cancro

Principal Investigator ITALIA

Fondazione Policlinico Universitario Agostino Gemelli IRCCS, Roma

Riferimento: Prof.ssa Domenica Lorusso

Telefono: 0630158545

Email: domenica.lorusso@policlinicogemelli.it

Localita: Roma